Apostle MiniMax™ Performance and Data

从血浆中进行 cfDNA 提取以用于液体活检

Apostle MiniMax 有效游离 DNA 提取试剂盒(标准版)是基于磁珠技术的游离 DNA (cfDNA)提取试剂盒。Apostle MiniMax 试剂盒已被证明在手动和自动化工作流程中从人类血浆中纯化 cfDNA。

  • 可处理 1-5mL 血浆样品
  • 与多种采血管兼容
  • 使用该试剂盒提取的 cfDNA 的纯度被证明适用于下游 PCR 应用及 NGS 检测

与多种采血管兼容

图1(下图):使用 Apostle MiniMax 试剂盒和市场上主流抽提试剂盒(Kit A)从 cfDNA Tube 1和 cfDNA Tube 2 中收集的 1mL 血浆中提取 DNA。同时使用 Apostle MiniMax 试剂盒、市场上主流抽提试剂盒(Kit A)及磁珠提取试剂盒(Kit B)从 EDTA 抗凝管 1mL 血浆中提取 DNA。采用 Quant-iT PicoGreen dsDNA 检测试剂盒(Thermo Fisher)对 DNA 进行定量。Error bar 表示三个重复的标准偏差。对于每个样品,Apostle Max 试剂盒有较高的 DNA 提取产量。使用安捷伦生物分析仪 2100 进行分析 DNA 片段大小,实验证明,从三种不同采血管中提取 DNA,均可获得预期片段大小   cfDNA(±170 bp)。

Genomics cfDNA Yield from Plasma

Figure 1

 

卓越的重现性

图2(下图):使用 Apostle MiniMax 试剂盒和其他品牌试剂盒从 cfDNA Tube 1 和 cfDNA Tube 2 中收集的 1mL 血浆中提取 DNA,每种方法重复一次,结果显示,采用 Apostle MiniMax 试剂盒提取的两个样品几乎相同,而使用试剂盒 A 提取 DNA 的曲线则明显不同 。使用安捷伦生物分析仪 2100 分析分离的 cfDNA;峰 35 和峰 10380 为内标。

Genomics cfDNA from Plasma Reproducibility

Figure 2

图 3( A),分别采用 Apostle MiniMax 试剂盒(红色曲线)和市场主流的抽提试剂盒(蓝色曲线)从 4 mL 血浆中分离富集 cfDNA。提取的 cfDNA 使用生物分析仪 2100 分析。图 3(B)显示,分别采用 Apostle MiniMax 试剂盒(红色曲线)和市场主流的抽提试剂盒(蓝色曲线)从 20 mL 尿液中分离富集 cfDNA。提取的 cfDNA 使用生物分析仪 2100 分析,并标出 ~170bp 的主峰。峰 35 和峰10380 是内标。如图示,对于血浆和尿液样本,Apostle MiniMax 试剂盒的表现优于主要替代产品。

Genomics cfDNA Isolation Characterized

Figure 3

DNA 突变检测和 qPCR 验证

在图 4 中,将 20µL 含有 EGFR C2573T>G L858R 突变的 DNA 合成片段(170 bp)掺入 1mL 的 TE 缓冲液(蓝色)或血清(红色),浓度范围为 0.001ng/µL 到 1ng/µL。使用 Apostle MiniMax 试剂盒抽提:A) 扩增曲线,显示突变片段在各个稀释浓度上, 使用 MiniMaxTM 有效游 离 DNA 分离富集试剂盒抽提前和抽提后呈现高度的重叠,B)用突变 DNA 片段标准品原液进行荧光定量 PCR,并得出标准曲 线。将 MiniMaxTM 有效游离 DNA 分离富集试剂盒抽提后产物曲线与之对 比,呈现出 DNA 片段 90% 以上的抽提效率。在图 5中,使用 Aposlte MiniMax 试剂盒和其他市场主流的抽提试剂盒(Kit A)之间的 qPCR 表现进行了比较。如图示,实验证明,从三种不同采血管中提取 DNA,Apostle MiniMax 试剂盒比试剂盒 A 表现更优异。

Genomics cfDNA Mutation Detection

Figure 4

Genomics cfDNA qPCR Performance

Figure 5

DNA 产量投入量增加

在图 6 中,从 Apostle MiniMax EDTA 管中的 1、3 和 5 mL 血浆中提取 DNA。如果使用 Apostle MiniMax 试剂盒,DNA产量会随着投入量增加而增加。使用 Quant–iT PicoGreen dsDNA 检测试剂盒(Thermo Fisher)对 DNA 进行定量。Error bar 表示三个复制的标准偏差。

Genomics cfDNA Yield Input Volume

Figure 6

工作流程视图

Genomics cfDNA Apostle MiniMax Workflow

  1. 血浆裂解
  2. cfDNA 与磁珠结合
  3. 磁珠与污染物分离
  4. 清洗磁珠
  5. 再次清洗磁珠
  6. 洗脱 cfDNA

 

产品:Apostle MiniMax 有效游离 DNA 提取试剂盒(标准版)

Apostle MiniMax 试剂盒可根据您的实验通量需求提供三种试剂盒规格:

PART # NAME PREPS
C40603 Apostle MiniMax™ 50
C40604 Apostle MiniMax™ 10
C40605 Apostle MiniMax™ Large Volume 50

 

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