SPRISelect Size Selection Performance and Data

SPRISelect 片段筛选试剂盒性能和相关数据

下一代测序 （NGS） 是当今基因组学研究中最普遍的技术。不同的应用有不同的建库需求，需要灵活的解决方案。而 DNA 片段的大小会直接影响测序数据的有效性。SPRISelect 试剂盒旨在让操作人员自由选择需要筛选的片段范围。该试剂采用经过成熟、业界领先的固相可逆固定 （SPRI） 技术，提供稳定的、可重复的和可定制的片段筛选功能。

• 可调 150 到 800 bp 片段筛选范围，便于调整用于特定应用和测序仪的片段
• 高效的磁珠技术消除了对凝胶、芯片或特殊仪器的需求
• 从手动到自动化，可在 96 孔板中进行高通量处理

双侧片段筛选功能

左侧片段筛选可移除小于目标片段的 DNA，而右侧片段筛选将移除大于目标片段的 DNA。通过利用左侧和右侧片段筛选，您可以获得更小范围的 DNA 片段。

使用 SPRISelect 试剂盒对大肠杆菌片段化的 gDNA 进行双侧筛选。[图 A] 通过一定比例左侧筛选获得主峰为 400bp 的片段。[图B] 通过一定比例右侧选择获得主峰为 200bp 的片段。[图C] 左侧筛选（红色）和右侧筛选（蓝色）的叠加。[图 D] 双侧筛选去除大于和小于目标的片段，并捕获 200bp-400bp 的目标片段范围。对于所有 DNA 片段测量使用 Agilent 2100 生物分析仪高灵敏度芯片（Agilent）。峰 35 和 10300 是内标。

可重复和可调性

SPRISelect 试剂是按照严格的规格要求生产的，可确保每次运行和批次间的可重复性。

使用 SPRISelect 对大肠杆菌片段化的 gDNA 进行了两种不同的片段筛选。每个片段选择执行三次。三个平行样品都显示出非常一致的片段筛选能力。（左）0.5X 左侧片段筛选（右）0.5X 右侧片段筛选。DNA 片段是使用安捷伦 2100 生物分析仪高灵敏度芯片（安捷伦）测量的。峰 43 和 115 是内标。

（左）0.5X 左侧片段筛选。（右）0.5X 右侧片段筛选。

更少的手动操作时间

使用 SPRISelect 试剂盒和另外两个市售试剂盒对大肠杆菌片段化的 gDNA 进行片段筛选对比。（左）该图表示单侧片段筛选或纯化时间。单侧筛选的 SPRISelect 工作流分别比供应商 A 和供应商 B 快 4.2 倍和 2 倍。（右）该图表示双侧片段筛选的时间。用于双侧筛选的 SPRISelect 工作流分别比供应商 A 和供应商 B的同类产品快 3.8 和 2 倍。SPRISelect 在所有三个供应商同类产品中所耗处理时间最少，至少为 50%。这个时间基于手动操作 8 个样本的片段筛选所获得。

SPRIselect Left 工作流程

选择比目标更大的 DNA 片段

1. 将 DNA 与磁珠结合
2. 将磁珠与杂质分离
3. 用 85% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
4. 将 DNA 从磁珠上洗脱
5. 转移到存储板

SPRIselect Right 工作流程

Selecting for DNA smaller than a target size or selecting for DNA within a target region.

选择比目标更小的 DNA 片段或在目标领域选择 DNA 

1. DNA 与磁珠结合
2. 将上清液转移到新板
3. 将 DNA 与磁珠结合
4. 将磁珠与杂质分离
5. 用 85% 乙醇清洗磁珠，去除杂质
6. 将 DNA 从磁珠上洗脱下来
7. 转移到存储板

兼容手动或自动化运行

使用 SPRISelect 对 8、24、48 和 96 个 DNA 样本执行双侧筛选所需的估计手动操作时间和总时间（以分钟为单位）。可以在 Biomek 工作站上手动或自动化执行不同的方法操作。该表表示在 Biomek i7 hybird 工作站上执行的自动化时间。显示手动和自动化之间的时间差异。NR = 不推荐。

用于片段筛选的产品

未用于或验证用于疾病或其他情况的诊断。

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