CosMCPrep Performance and Data

高低拷贝数质粒纯化

CosMCPrep 是一种基于固相可逆固定 (SPRI) 顺磁微珠技术的多功能质粒纯化试剂盒。CosMCPrep 可以用于纯化各种高拷贝数和低拷贝数模板,同时维持灵活性以支持手动和自动处理。

  • 提取高质量质粒
  • 实现纯化所有模板类型
  • 自动化方法保证稳定的质粒产量和质量

 

从大肠杆菌和绿脓杆菌中高回收高质量小质粒 DNA 和大质粒 DNA

Plasmid Type Concentration (ng/µl)  Yield (µg) 
High copy number small (<10kb) plasmid 359.2 14.4
High copy number small (<10kb) plasmid isolated from Pseudomonas  120.0 4.8
Naturally occurring large (>100kb) plasmid 90.3 3.6

Genomics CosMCPrep Performance Plasmid Purity

Figure 1

使用 CosMCPrep 试剂盒从两个大肠杆菌菌株中提取质粒;其中一个菌株携带高拷贝数小质粒(<10kb),另一个菌株携带天然的大质粒(>100kb),同时绿脓杆菌携带高拷贝数小质粒。使用 NanoDrop(Thermo Fisher)测定质粒 DNA 的浓度和产量。使用 NanoDrop(Thermo Fisher)评估质粒纯度。

在图 1(右图)中,所有质粒的 A260/280 和 A260/230 比率均符合下游应用的合格比率。*A260/280 的可接受比率为 1.8 -2.0,A260/230 的可接受比率为 2.0-2.2,但由于核苷酸比和 DNA 浓度不同,此比率可能更高(赛默飞科技 T042-技术公告)。

 

微量、小量或大量样品都使用相同的试剂盒

Volume of Overnight (mL)  Average Concentration (ng/µl)  Average Yield (µg)  Average A260/A280  Average A260/A230 
0.8 258 10.3 2.1 2.0
2 1893 74.0 2.2 2.8
5.5 2978 298.0 1.9 2.4

Genomics CosMCPrep Performance Volume Overnight

Figure 2

从大肠杆菌中分离出高拷贝数小质粒(<10kb)。取过夜培养菌液,三个不同体积,裂解,使用 CosMCPrep 试剂盒分离质粒。投入量与质粒浓度成线性关系。

兼容质粒类型:

  • 低拷贝数质粒
  • 高拷贝数质粒
  • BACs
  • Cosmids
  • Fosmids
  • 天然大质粒

 

CosMCPrep 需要更少的动手操作时间

与使用柱提法的试剂盒相比,使用 CosMCPrep 试剂盒提取疟原虫DNA需要更少的动手时间和更少的移液步骤。图 3 表示使用 CosMCPrep 试剂盒或柱提法的试剂盒从样本中制备质粒的总时间。10 个样本时,使用 CosMCPrep 试剂盒可以更快地制备质粒。移液器操作的总数(图 4),是制备 1、8、24、48 和 96 个样本时动作,包括样品中的加样、混样和丢弃吸头等。使用多通道移液器时,与柱提法的试剂盒相比,需要执行的移液操作要少得多。

Genomics Genfind v2 DNA Yield

Figure 3

Genomics Genfind v2 DNA Purity

Figure 4

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

工作流程视图

 Genomics CosMCPrep DNA Plasmid Purification 
  1. 收集细胞沉淀
  2. 使用 RE1 重悬细胞
  3. 使用 L2 裂解细胞
  4. 使用 N3 中和
  5. 离心和转移上清液
  6. 将质粒 DNA 与磁珠结合
  7. 将磁珠与杂质分离
  8. 用 70% 乙醇清洗磁珠,去除杂质
  9. 重复洗 3 次
  10. 从磁珠中洗脱质粒
  11. 转移到新的孔板

 

用于质粒纯化的 CosMCPrep 试剂盒

CosMCPrep 试剂盒根据您的实验通量需求提供两种试剂盒规格。单击下方的货号进行购买或询价。想要了解更多信息,请查看我们关于 CosMCPrep 试剂盒在 DNA 质粒纯化方面的应用。

PART # NAME PREPS
A37064 CosMCPrep  384
A29174 CosMCPrep  4000

 

 

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