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细胞识别参数设置指南和优化
BLU 自带 7 种细胞识别参数:
- BCI 默认 – 通用
- 哺乳动物 – 适用于CHO、HEK、PBMC
- 昆虫 – 适用于SF-9、SF-21
- 酵母 – 适用于生物燃料、啤酒厂、发酵应用
- BCI Viab 微球 – 和BLU活率质控品一起使用
- BCI Conc 微球 – 和BLU浓度质控品一起使用
- BCI L10 微球 –和L10(10um)粒径标样质控品一起使用
目前软件自带的默认细胞识别参数适用于许多细胞类型。对于某些细胞株,需修改识别参数以优化细胞分析结果。
细胞识别参数从XR迁移至 BLU
XR到BLU转换推荐使用的各个参数数值,请联系您的贝克曼库尔特生命科学工程师以获取更多帮助。
XR 设置 | BLU初始设置值 | |
---|---|---|
最小 | 相同 | -1 um |
最大 | 相同 |
-1 um |
拍照张数 | 50 | 50 or 100 |
吹打混悬 | 相同 | 3 |
染色混匀 | 相同 | 3 |
细胞亮度 | 85 | N/A |
细胞锐度 | 100 | 7 |
80 | 15 | |
60 | 20 | |
活细胞光斑亮度 | 85 | 55 |
75 | 50 | |
65 | 40 | |
活细胞光斑面积 | 相同 | 相同 |
最小圆度 | 相同 | 相同 |
去团聚度 | 相同 | 相同 |
细胞识别参数 | 常用范围 | 全范围值 | 该数据变大的影响 | 该数据减小的影响 | 何时/为何更改此参数设置 | 警告 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
定义是否存在该类细胞 |
最小粒径 |
5 to 12 µm |
1 to 60 µm |
识别出更少细胞 |
识别出更多细胞 |
软件将排除小粒径细胞(圈蓝) 包括细胞碎片 |
该参数设置太低,可能包含细胞碎片 设置太高,可能排除目标细胞 |
最大粒径 |
15 to 50 µm |
1 to 60 µm |
识别出更多细胞 |
识别出更少细胞 |
软件将排除大粒径细胞(圈蓝) 包括细胞团 |
该参数设置太低,可能排除目标细胞 设置太高又会包含细胞团 |
|
细胞锐度 |
5 to 25 |
0 to 100 |
识别出更少细胞 |
识别出更多细胞 |
软件将排除“模糊”细胞 不需要的细胞碎片被同时标记 |
该参数设置太高可能导致死细胞被排除,从而改变细胞活率。 |
|
定义已识别的细胞为活细胞还是死细胞 |
活细胞光斑亮度 |
40 to 60% |
0 to 95% |
更多细胞被识别为死细胞 |
更多细胞被识别为活细胞 |
活细胞被识别为死细胞 死细胞被识别为活细胞 |
该参数设置太低,可能将死细胞识别为活细胞;参数设置太高,可能将活细胞识别为死细胞 |
活细胞光斑面积 |
3 to 12% |
0 to 95% |
更多细胞被识别为死细胞 |
更多细胞被识别为活细胞 |
活细胞被识别为死细胞 死细胞被识别为活细胞 |
该参数设置太低,可能将死细胞识别为活细胞;参数设置太高,可能将活细胞识别为死细胞 |
|
定义是否存在该类细胞 |
最小圆度 |
0 to 0.60 |
0 to 1.00 |
更多形状不规则的死细胞将被排除 |
更少形状不规则的死细胞将被排除 |
不需要的不规则细胞碎片被同时标记 |
该参数设置太低,可能捕获不需要的细胞碎片;参数设置太高,可能排除目标细胞 |
团聚度 |
无,低到中 |
N/A |
识别出更多细胞 |
识别出更少细胞 |
单个细胞被识别为2个或多个细胞 |
该参数设置太低,可能识别出细胞团中缺失的细胞;参数设置太高,可能将单个细胞识别为 2 个或多个细胞 |
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细胞锐度 |
细胞锐度是测量细胞边缘的量度,范围为 0-100。减小该值可将模糊颗粒识别为目标细胞。增加锐度将从目标细胞计数中减掉模糊细胞。 |
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活细胞光斑亮度 |
活细胞光斑亮度表示细胞中心亮度,以确定测量细胞为活细胞或死细胞(以绿色或红色显示)。该参数设高,则具有明亮白色中心的细胞被计为活细胞(细胞活率将减小)。该参数设低,则具有灰色中心的细胞将被计为活细胞(细胞活率将增大)。检查图像中的颜色标记以确定活细胞光斑亮度参数是否正确设置非常重要。 |
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活细胞光斑面积 |
活细胞光斑面积表示细胞白色区域的面积百分比,以确定细胞为活细胞或死细胞。该参数设高可能导致一些活细胞被计为死细胞。通常无需调整此参数。 |
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最小圆度 |
此参数用于消除细胞碎片干扰。假设设置为“1”代表是标准的圆形。 |
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团聚度 |
团聚度表示细胞团的分布强度。None(无)代表不会对任何细胞团块进行团聚分析 - 适用于不含细胞团的样品。Low(低)适用于具有2-3个细胞团的样品。Medium(中)适用于超过3个细胞团的样品。High(高)适用于酵母细胞。 |